接着上集，林子颖（袁咏仪饰）搬入Sam（张国荣饰）公寓与其同居。可是不过10日，Sam就对这种平淡琐碎的生活产生了厌烦，他希望两人能保持一定的距离。在好友肥婆（曾志伟饰）的建议下，Sam要阿颖以男装重回娱乐圈，本意是要分散她的注意力，不料却获得空前成功，Sam被指为同性恋加吃软饭，感到脸上无光的他开始对阿颖恶声恶气起来。
楼下搬来一个谜样的女人方艳梅（梅艳芳饰），气质高雅，女人味十足。在她的开导下，阿颖渐渐走出忧郁，却发现自己对方姐生出异样情愫，而对方似乎也大胆地回应她的感情。Sam和方姐之前曾有过一夜情，他自以为是地保持和方姐的暧昧。有一天，Sam终于发现了阿颖和方姐之间的不对劲……
剧情版本二：
女扮男装的小歌迷林子颖(袁咏仪)混进乐坛，几经波折，终与金牌监顾家明(张国荣)结为一对性别模糊的爱侣。颖受家明的爱情与事业滋润，竟夺得最受欢迎男歌星奖，锋头一时无两，兼且骑虎难下，性别真相，公布无期。传说中的百变巨星方艳梅(梅艳芳)重出江湖，但吃惊的是她和顾家明、林子颖同时发生感情。
梅艳芳饰演淡出乐坛的歌手方艳梅，周游列国之后，再次踏足香港这片土地，结识了女扮男装的新进歌手林子颖，两人感情要好，似是而非的爱上对方。后来她也知道林子颖的身份，但仍深感庆幸跟她相识，因为她让她知道，这世界上仍有纯真的小白兔。最后她又再拾起行囊，继续其穿州过省的生活。
评析 《金枝玉叶 2》－－豪华堆砌的性别迷惑 九四年陈可辛导演的爱情喜剧《金枝玉叶》颇受欢迎，收入二千九百万元，现在第二集除了原班明星张国荣、袁咏仪和陈小春，还增添梅艳芳和李绮虹，上集的刘嘉玲亦有出场，卡士更强。虽然票房难以预测，但这续集在午夜场收得，是暑假后段的重头港片。
金枝玉叶 2》拍得十分豪华时髦，简直金碧辉煌，不过很堆砌姿整。如果但求看明星、看靓屋豪宅、漂亮画面和时尚玩意，当可目不暇给，趣趣致致。剧情则不再是上集那种灰姑娘狂想曲，而变成得宠小姐「纵坏」地「玩o野」。
袁咏仪在上集是九龙城旧屋少女，是崇拜歌星的「FAN屎」，为求接近偶像不惜女扮男装参加新秀比赛。到了续集，她本身已经当上歌坛新偶像，还搬入豪宅，与作曲家张国荣共赋同居。 本片比较有趣的地方是袁咏仪得意忘形，不但把「成间百货公司」搬入新居，连死党陈小春也搬来，弄到张国荣烦不胜烦。她大红大紫，反客为主地要养起张国荣，颁奖礼一场特别令张国荣尴尬好笑。 袁咏仪一朝成功，还移情别恋，跟天王歌后梅艳芳燃起同性爱火，痴缠搞基。不过张国荣爱心不变，十分伟大。
金枝玉叶 2》比上集进一步大玩同性异性挛挛直直的关系，剧情却更「 戏来做」，难以置信。其实袁咏仪假扮男人扮得不似，明明是女人，上集说她在短期内骗到人尚算勉强成立，但到了续集，无数歌迷仍然当正她是男人，连梅艳芳也以为她是男人，疯狂爆料睇真D的传媒也看不出她是女人，真是「呃鬼食豆腐」。 太多港片不理会起码的可信性了。此片看来想拍同性恋，出现很多基男基女，同时又想迎合异性恋主流观众，希望一举两得。这在市场上或许有效，却难免过於媚俗，挛挛直直得吞吞吐吐，扭扭拧拧得太不爽快。
那三位主角到底是不是基？实在混淆不清。只能说此片充满「身份之谜」和「性别情意结」，总想甚麽都有，却不大知道真正要甚麽，或许代表了时下某种香港式迷惑吧？ 较爽趣是陈小春和李绮虹这一对。梅艳芳则气派不错。最有风韵却是客串露面的刘嘉玲。
幕后制作
创作背景
1994年的电影《金枝玉叶》上映后叫好又叫座，票房口碑双赢，在陈可辛眼中是无续集可言的。但是陈可辛拍摄的另一部电影《嫲嫲帆帆》却遭遇了票房惨败，电影出来之后亏损严重。为了挽回公司的损失，陈可辛接受公司建议，开始准备他并不想拍的《金枝玉叶》续集。即便如此，陈可辛因为无法决定续集的构思，只能一直停工不动，那时候他有两个想法，一个是拍《甜蜜蜜》，另一个是拍婚外情的故事。后来在钟珍等人启发建议下，才又决定把婚外情的设想放入《金枝玉叶2》中，陈可辛与张国荣谈后，张国荣也同意了这一想法。这时才到了《金枝玉叶2》真正起步阶段 。
后期制作
同样是CINEFIL IMAGICA制作发售的日二限量版DVD，封面设计除了在颜色上一脉相承于前作之外，风格已是大变。张国荣和袁咏仪占据了封面的大部分，版面的视觉效果不俗。遗憾的是日版此集为剪辑版，因此市面版本实际收录的是美亚在港三发售的完整版。此外《金枝玉叶》的英文名叫《he's a woman she's a man》，到了《金枝玉叶2》名字已经改成了《who's the man who's the woman》 。
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